関西のある地方にはクモ自身縁起が良いものだから殺してはいけない、というジンクスがあるそうです。お金のことを「おあし」と隠語でいうそうで(まるで足があるようにお金はすぐどこかへ行ってしまうことから)、おあしのたくさんあるクモを殺すとお金を失うからだそうです。さすが、商人の町ですね。
また東北のある地方では、夜のクモは必ず殺すそうです。理由は「夜蜘蛛来たな」(よくも来たな)という洒落からだそうです。(洒落で殺されるクモもなんか可愛そうな気がしなくもない…)
いずれも迷信ですが、クモがものすごく嫌いでなければ、益虫なので殺さずにそっと外へでも逃がしてやるのがよろしいかと思いますが。
ただ、只今繁殖中のセアカゴケグモだけには注意してくださいね。